napari

napari využívá sílu Pythonu k umožnění rychlého a interaktivního prohlížení, anotace a analýzy velkých vícerozměrných obrázků.

• prohlížet a zkoumat 2D, 3D a vícerozměrné pole na plátně;
• překrývat odvozená data, jako jsou body, polygony, segmentace a další;
• anotovat a upravovat odvozené datové sady pomocí standardních datových struktur, jako jsou pole NumPy nebo Zarr, což vám umožní
• hladce propojit zkoumání, výpočty a anotace v analýze obrazových dat.

napari je rychlý, interaktivní, multidimenzionální prohlížeč obrázků s dynamickým ekosystémem pluginů, který rozšiřuje jeho schopnosti řešit různé doménově specifické potřeby vizualizace a analýzy. Je postaven na Qt (pro GUI), vispy (pro výkonné renderování založené na GPU) a vědeckém Python stacku (numpy, scipy a scikit-image).

napari je open source projekt na GitHubu, který usnadňuje transparentnost, opětovné použití a rozšiřitelnost.

V jádru poskytuje důležité funkce prohlížeče, které jsou ihned k dispozici, jako je podpora velkých multidimenzionálních dat, „vrstvy“ pro současnou vizualizaci obrázků, modelů a výsledků analýzy a snadné ruční interaktivní anotace ve 3D.